O interior é de nave única com coro e capelas laterais. É decorado com talhas douradas, mármores, telas e tetos pintados.
Na capela-mor está o tumulo da rainha D. Mariana Vitória, mulher do rei D. José I, integrado no arcossólio na parede oeste.
O convento está classificado como Imóvel de Interesse Público. O túmulo da rainha D. Mariana Vitória está classificado como Monumento Nacional.
