É o mais importante museu de arte destes séculos em Portugal.
O museu localiza-se no Palácio de Alvor-Pombal, um palácio dos finais do século XVII mandado construir por D. Francisco de Távora, primeiro conde de Alvor.
Foi alugado pelo Estado Português e depois adquirido para ali ser instalado o Museu Nacional de Bellas Artes e Arqueologia, inaugurado em 11 de Maio de 1884.
O palácio era vizinho do Convento de Santo Alberto, o mosteiro de freiras carmelitas descalças em Lisboa. Quando a última freira morre, em 1890, o estado toma posse do Convento que é depois derrubado e construído no seu lugar um anexo ao museu.