O nome de Nossa Senhora da Luz foi atribuído em 1578 por o convento estar situado no vale de Montes Claros. Teve grandes melhoramentos a nível da decoração no reinado de D. João V, como por exemplo os painéis de azulejos da capela-mor.
Aqui esteve sepultada a duquesa D. Leonor assassinada pelo marido Duque D. Jaime em 1512, até ser transladada para o Convento da Esperança de Vila Viçosa em 1590.
Em 1834, com a extinção das ordens religiosas, o convento passou para privados.