Atualmente, existem só partes desta cerca seiscentista datada do séc. XVII que envolvia toda a cidade. Estas muralhas serviram para defesa de Faro das tropas miguelistas.
Datado do séc. XVI, as obras da igreja e do convento foram terminadas pela Rainha D. Catarina. Sobre uma antiga judiaria, é um exemplo da arte renascentista no Algarve.
Em finais do séc. XVI o bispo D. Afonso Castelo Branco mandou edificar a Igreja da Misericórdia sobre as ruínas da antiga ermida do Espírito Santo numa mistura do barroco e manuelino.
A sua construção iniciou-se no final do séc. XVII, sofrendo alterações de ampliação nos séc. XVIII até às primeiras décadas do séc. XIX, quando foi concluída a fachada.
